سیستم عامل ویندوز ۹۸ نسخه اس ای ( Second Edition ) در تاریخ ۲۳ آپریل سال ۱۹۹۹ منتشر شد . این نسخه در حقیقت نسخه بروز رسانی و بهینه سازی شده از نسخه ویندوز ۹۸ است . این نسخه از بسیاری از جهات دارای اهمیت فراوانی است . دلیل این امر امکانات زیادی است که به آن اضافه شده . این امکانات شامل اضافه شدن شناسایی خودکار برای مودم ها ، کارت های صدا و درایو های USB می باشد . همچنین نسخه بروز رسانی شده Internet Explorer به ۵ ، اضافه شدن Web Folders ، تغییرات کلیدی در Windows Explorer ، بروز رسانی برای شناسایی پرت فایر وایر ، سرویس اشتراک گذاری اینترنت ، جایگزین شدن ئیندوز میدیا پلیر ۶.۲ با نسخه قبلی ، بروز رسانی نسخه Direct X به ۶.۱ از جمله این تغییرات بودند .